Фамилия Абыков образована от тюркского имени Абык. Это имя, в свою очередь, восходит к арабскому «абид» — «поклоняющийся», «раб Божий». В тюркской среде, особенно у татар и башкир, имя Абык (иногда в форме Абик, Абый) было распространено как вариант, возникший из-за фонетических особенностей местных говоров: звук «д» на конце перешел в «к», а гласный стал более узким. Следовательно, Абыков — это буквально «сын Абыка» или «потомок Абыка».

Суффикс -ов указывает на русский способ оформления фамилий, типичный для многих нерусских народов Российской империи, принявших православие или просто адаптировавших свои фамилии к русскому делопроизводству. В среде крещеных татар (например, кряшен) или башкир фамилии на -ов стали нормой в XIX веке. Таким образом, Абыков — фамилия не столько русская по корню, сколько по модели, а её основа — чисто тюркская и религиозная.

Интересно, что в некоторых тюркских языках слово «абык» могло иметь и бытовое значение — «дед», «старик», «уважаемый человек». Но в данном случае, учитывая распространенность личного имени Абык, именно антропонимическая версия выглядит убедительнее. Фамилия встречается преимущественно в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях — регионах традиционного расселения тюркских народов.

Встречается и вариант ударения: на первый слог (Абыков) или на второй (Абыков). В русском языке ударение чаще ставят на второй слог, что сближает фамилию с привычной моделью «Абы́ков». В самой же тюркской среде ударение может падать на последний слог — Абыко́в, как это свойственно многим татарским фамилиям.