Фамилия Агадюков — редкий случай, когда географический акцент в основе просматривается чётче, чем в типовых русских фамилиях. Разберёмся с корнем.

В центре фамилии — прозвище или мирское имя Агадюк. Его основа — тюркское слово ага (старший брат, господин, начальник) с характерным для южнорусских и украинских говоров суффиксом -юк. Этот суффикс (как и -ук, -чук) в фамилиях указывает на принадлежность к роду или на уменьшительность: буквально «маленький ага» или «сын аги». Таким образом, Агадюк — это либо «младший начальник», либо «потомок старшины».

Притяжательный суффикс -ов в конце — стандартный русский патроним: «чей?» — Агадюков, то есть «сын Агадюка». Вся конструкция типична для юга России и Украины, где фамилии на -юков (ср. Костюков, Левчуков) встречаются чаще, чем в северных областях.

Самое интересное — социальный контекст. В XVI–XVII веках слово «ага» в русских документах фиксировалось как обозначение турецкого или татарского военачальника. Поэтому носитель прозвища Агадюк мог быть выходцем из служилых татар, перешедших на русскую службу, или казаком, получившим прозвище за командные замашки. Фамилия почти наверняка сформировалась в среде однодворцев — потомков пограничной стражи, которые селились на южных рубежах и носили фамилии с тюркскими корнями.

Встречается фамилия и в написании Агадюков (через «о» в суффиксе — норма для русского окончания), и изредка Агадюковъ в дореволюционных записях. Вариант с двумя «г» (Аггадюков) — ошибка переписчиков: корень короткий, удвоение неоправданно. По данным современных справочников, фамилия остаётся малочисленной и фиксируется преимущественно в Ростовской области и Краснодарском крае — как раз в зоне бывшего «Дикого поля», где смешивались славянские и тюркские роды.