Фамилия Агатуллин — один из тех случаев, где русская письменность зафиксировала тюркское имя почти без искажений. Её основа — мужское личное имя Агатулла, пришедшее из арабского языка через татарскую или башкирскую традицию. «Агатулла» переводится как «дар Аллаха» (от «агат» — дар и «Аллах» — Бог). Это теофорное имя, то есть содержащее указание на Бога, — распространённый тип в мусульманских культурах, наряду с Абдуллой (раб Аллаха) или Ахмадуллой (восхваляющий Аллаха).

Русский суффикс -ин указывает на принадлежность: Агатуллин буквально означает «сын Агатуллы» или «потомок Агатуллы». По модели образования фамилия типична для Поволжья и Приуралья, где русский патронимический суффикс часто присоединялся к тюркским основам, создавая гибридные формы. В отличие от фамилий на -ов, которые в тюркской среде тоже встречаются, -ин здесь может указывать на более раннюю или более тесную ассимиляцию в русскую среду, хотя это не строгое правило — скорее региональная особенность, чем закономерность.

Географически фамилия Агатуллин сосредоточена в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях. Носители — почти исключительно татары и башкиры, реже — представители других тюркских народов России. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках фамилия встречается с середины XIX века, когда у татар и башкир начали массово закрепляться наследственные фамилии. До этого человека называли по отцу: «Агатуллин сын», что со временем и стало фамилией.

Любопытная деталь: в некоторых диалектах татарского языка имя могло звучать как Агатулла, но встречался и вариант Ахтатулла — с тем же значением. В русской записи разница стиралась, и обе формы дали фамилию Агатуллин. Спорных версий у фамилии нет — корень прозрачен, а суффикс стандартен. Редкость фамилии в том, что она почти не встречается за пределами традиционного татаро-башкирского ареала, что делает её хорошим маркером происхождения. Если искать предка по фамилии Агатуллин, стоит начинать с метрик мечетей и ревизских сказок по Казанской, Уфимской или Оренбургской губерниям — именно там фамилия закрепилась и передавалась по мужской линии.