Фамилия Агидуллин — один из ярких примеров того, как русский язык освоил и переоформил арабское имя, попавшее в Поволжье через тюркскую среду. В основе фамилии лежит мужское мусульманское имя Агидулла, точнее — его диалектный или разговорный вариант. Классическая арабская форма звучит как Агидуллах (от «агид» — верующий, и «Аллах» — Бог), то есть «верующий в Аллаха». В татарской и башкирской среде, где имя широко бытовало, конечный звук «х» часто редуцировался, и имя приобрело форму Агидулла.

Русский суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Агидуллин, то есть сын или потомок Агидуллы. Это стандартная модель образования фамилий у народов Поволжья, принявших православную или, в данном случае, адаптированную к русской делопроизводственной традиции форму. Суффикс -ов в этой фамилии не встречается, что характерно для многих татарских и башкирских фамилий, оканчивающихся на -ин (ср. Ахметшин, Каримуллин, Сафиуллин).

Географически фамилия Агидуллин плотно привязана к Волго-Уральскому региону: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская и Челябинская области, а также диаспоры в Средней Азии. Встречаемость фамилии невысокая, что говорит о локальном распространении родового имени. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках эта фамилия фиксируется с конца XVIII — начала XIX века, когда у татар и башкир начался массовый процесс закрепления наследственных фамилий.

Интересная деталь: в некоторых говорах и старых записях можно встретить вариант Агидулов — с заменой конечного -ин на -ов по аналогии с более привычными для русской бюрократии формами. Но именно форма Агидуллин точнее передаёт исходное имя и считается нормативной. Предки носителей этой фамилии, скорее всего, были крестьянами или мещанами, а само имя Агидулла могло быть дано в честь деда или уважаемого односельчанина, известного своей набожностью.