Фамилия Агидуллина — женская форма фамилии Агидуллин, и её разбор стоит начать с разгадки тюркского корня. Основа «Агидулла» — это искажённое в русской записи арабское имя «Агидуллах» (или «Агидулла»), которое состоит из двух частей: «агыд» (араб. ‘акид — «верующий», «убеждённый») и «улла» (араб. ‘Аллах — «Бог»). Таким образом, имя Агидулла значит «уверовавший в Аллаха», «твердый в вере». Это типичное для мусульманских народов Поволжья и Приуралья теофорное имя, то есть имя, восхваляющее Бога.

Модель образования фамилии проста и характерна для татарской, башкирской и других тюркских ономастик: к личному имени Агидулла добавили русский патронимический суффикс -ин, который в тюркской среде закрепился в период Российской империи при массовой фиксации фамилий. Суффикс -ин, а не -ов, здесь не случаен: в татарском языке имена, оканчивающиеся на гласный (как Агидулла), часто давали форму на -ин. Сравните: Агишев (от Агиш) и Агидуллин (от Агидулла). Окончание -а в женской форме — стандартная грамматическая русификация.

Географически фамилия Агидуллина (и Агидуллин) наиболее распространена в Татарстане, Башкортостане, а также среди татарской диаспоры в Оренбургской, Челябинской областях и в Средней Азии. Встречаемость невысокая, что говорит о конкретном роде, восходящем к одному предку, носившему имя Агидулла. Этот человек, вероятно, жил в XVIII–XIX веках в одном из татарских или башкирских селений.

Примечательная деталь: в дореволюционных метрических книгах и переписях фамилия могла записываться по-разному — Агидуллин, Агидулов, а иногда и как Агидуллаев (с более поздним тюркским суффиксом -ев). Вариант Агидуллин — самый частый и стандартизированный в советское время. Социальный слой предков — в основном крестьяне-земледельцы, реже — ремесленники или муллы, так как имя Агидулла давали людям с подчёркнутой религиозностью, но не обязательно духовного звания.

Таким образом, фамилия Агидуллина — это «дочь (или жена) Агидуллы», где Агидулла — человек, чьё имя было призвано напоминать о крепости веры. Никакой другой, более древней или славянской, версии у этой фамилии нет.