Основой фамилии Акиндинов послужило церковное имя Акиндин. Фамилия Акиндинов происходит от календарного мужского имени Акиндин. Это имя в переводе с греческого означает «безопасный». Согласно другой, менее правдоподобной версии, эта фамилия образована от турецкого слова akinci, что в переводе на русский язык означает «тот, кто совершает набеги; налетчик». В таком случае, можно предположить, что основатель рода Акиндиновых был воином. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Акиндин, со временем получил фамилию Акиндинов.