Фамилия Акинов образована от крестильного имени Акинф (Акинфий) — церковной формы греческого Иакинф, что означает «гиацинт». Однако напрямую к полной форме имени восходит более распространённая фамилия Акинфиев, а Акинов — результат одного из типичных для русской ономастики сокращений. Имя Акинф в бытовой речи часто усекали до Акиня или Акин, от которого и пошла фамилия с патронимическим суффиксом -ов.

Суффикс -ов указывает на то, что фамилия закрепилась в центральных и северных регионах России в XVI–XVII веках, когда основная масса крестьян и служилых людей получала фамилии по отцу. Акинов буквально значит «сын Акина». Интересно, что в некоторых говорах имя Акинф произносили с ударением на первый слог — А́кин, что и дало основу без «ф». Такой переход согласного «ф» в «в» или его полное исчезновение — характерная черта народной русской речи, избегавшей звука «ф» в заимствованных именах.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с тюркским именем Акин, которое встречалось у татар и башкир и означает «поток» или «течение». В этом случае фамилия Акинов могла возникнуть в среде крещёных татар или в зонах русско-тюркского пограничья. Но для большинства носителей фамилии более убедительным остаётся происхождение от православного имени Акинф: именно на эту версию работают и география распространения фамилии (преимущественно русские области), и типичная модель с суффиксом -ов.

Среди однокоренных фамилий — Акинфиев, Акиньшин, Акиншин, Акатов. Последняя, кстати, произошла от той же основы, но через другую диалектную форму — Акат (сокращение от Акатий, ещё один вариант имени Акинф). Таким образом, фамилия Акинов — не редкая, но и не массовая, она хранит след живого произношения имени, которое в церковных книгах писали иначе, чем выговаривали в крестьянской избе.