Фамилия Акинов — один из тех случаев, когда церковное имя в народной речи обросло бытовыми сокращениями и дало начало новой фамильной ветви. В основе лежит крестильное имя Акинф (полная форма — Акинфий), которое восходит к греческому Иакинф, то есть «гиацинт». Однако напрямую от полной формы образована более известная фамилия Акинфиев, а Акинов пошла от усечённого варианта — Акин или Акиня. Именно так имя звучало в повседневном общении, а затем закрепилось с патронимическим суффиксом -ов, означающим «сын Акина».

Суффикс -ов указывает на географию и время формирования фамилии: центральные и северные русские земли XVI–XVII веков, когда основная масса крестьян и служилых людей получала фамилии по отцу. Интересная деталь — в некоторых говорах имя Акинф произносили с ударением на первый слог: А́кин. Это и дало основу без конечного «ф». Такой переход согласного «ф» в «в» или его полное исчезновение — характерная черта народной русской речи, которая избегала непривычного звука «ф» в заимствованных именах.

Существует менее вероятная, но возможная версия, связывающая фамилию с тюркским именем Акин, встречавшимся у татар и башкир и означающим «поток» или «течение». В этом случае Акинов могла возникнуть в среде крещёных татар или в зонах русско-тюркского пограничья. Однако для большинства носителей фамилии убедительнее православное происхождение: на это работают и география распространения (преимущественно русские области), и типичная модель с суффиксом -ов.

Среди однокоренных фамилий — Акинфиев, Акиньшин, Акиншин, а также Акатов. Последняя произошла от той же основы, но через другую диалектную форму — Акат (сокращение от Акатий, ещё один вариант имени Акинф). Таким образом, фамилия Акинов — не редкая, но и не массовая, она хранит след живого произношения имени, которое в церковных книгах писали иначе, чем выговаривали в крестьянской избе.