Фамилия Акинитова — женская форма, её основа мужская — Акинитов. Корень здесь не от распространённого календарного имени, а от его народной, разговорной формы. Речь об имени Акиний, которое в русской традиции возникло как упрощение церковного Иоаким (в просторечии — Яким, Аким). Форма «Акиний» встречалась в северных и центральных говорах, где конечное -ий часто заменяло более привычное -им. Таким образом, Акинитов — буквально «сын Акиния» или «человек из рода Акиния».

Суффикс -ов указывает на типичную для XVII–XIX веков притяжательную модель: сначала так называли детей и домочадцев, потом фамилия закреплялась за целым родом. Менее вероятная, но допустимая версия — связь с прозвищем Акинит, которое могло относиться к человеку, носившему имя Акиний, но в быту звавшемуся через уменьшительно-пренебрежительный суффикс -ит (например, по аналогии с «Васит» от Василий). Однако эта модель редка, и основная гипотеза всё же надёжнее.

Географически фамилия Акинитов (и Акинитова) нечастотна. Встречается в основном в регионах, где было сильно влияние северо-русских говоров — Вологодская, Архангельская области, а также в Поволжье, куда переселенцы принесли свои диалектные формы. В дореволюционных метрических книгах носители фиксировались преимущественно среди крестьян и мещан, то есть сословий, где фамилии складывались поздно и часто из отчеств, а не из боярских прозвищ.

Написание через «и» после «к» (Акинитова, а не Акиметова или Окинитова) выдаёт именно разговорную, а не книжную фиксацию. Если бы фамилия образовалась от полного церковного имени, мы бы видели вариант Иоакимов или Акимов. Акинитов — свидетельство того, что в быту имя жило в своей особой, местной огласовке, и эта форма закрепилась в документе. Такой переход от церковного Иоаким к народному Акиний, а затем к фамилии Акинитов — типичный пример того, как живая речь перерабатывала книжные формы и закрепляла их в родовых именованиях.