Фамилия Акулинушкина — редкий пример того, как женское имя стало основой для родового прозвания. В её основе лежит старинное имя Акулинушка, которое само по себе является уменьшительно-ласкательной формой от двух возможных источников. Первый и более вероятный — мужское имя Акила (в переводе с латыни «орёл»), которое в народной речи превратилось в «Акул», а затем в «Акулинушка». Второй вариант — женское имя Акилина (Акулина), от которого та же форма образовалась напрямую. В любом случае, суффикс -ушк- в основе указывает на ласкательное, домашнее обращение, а фамильный суффикс -ин принадлежит к самой распространённой модели русских фамилий, отвечая на вопрос «чей?» — то есть «сын Акулинушки» или «дочь Акулинушки».

Поскольку имя Акулинушка не было дворянским или книжным, а бытовало в простонародной среде, можно с уверенностью сказать, что предки носителей фамилии относились к крестьянскому или мещанскому сословию. В документах XVII–XIX веков такие фамилии часто закреплялись за крепостными крестьянами или посадскими людьми, у которых полное церковное имя заменялось обиходным вариантом.

С географической точки зрения фамилия Акулинушкина встречается крайне редко, что делает её своеобразным маркером для генеалогического поиска. Основные очаги бытования — центральные и северные регионы России, где были распространены производные от имени Акила. Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Акулов, Акулинин, Акулишин, — то Акулинушкин выделяется именно двойным уменьшительным суффиксом, что усиливает его «домашний», неофициальный характер. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) такая модель описана как типичная для фамилий, образованных от ласкательных форм, но конкретно этот вариант встречается реже других. Таким образом, фамилия Акулинушкина — не просто указание на родство, а сохранившееся в веках ласковое прозвище, которое когда-то дали ребёнку или взрослому в кругу семьи.