Фамилия Акулюшина — женская форма от Акулюшин, и чтобы понять её корни, нужно разобраться с мужским вариантом. В его основе почти наверняка лежит личное имя или прозвище Акулюша. Вопрос в том, откуда взялось само это имя. Здесь есть несколько версий, и ни одна не выглядит надуманной.

Первая и самая прямая версия ведёт к редкому церковному имени Акила. В переводе с латыни aquila означает «орёл». В народной речи имя Акила часто переделывали в более привычные формы — Акул, Акула, а ласкательно — Акулюша. Так что основатель рода Акулюшиных мог быть человеком, которого в быту звали Акулюшей, то есть уменьшительно от Акилы. Поскольку такие сокращённые формы в старину были распространены в основном среди крестьян и посадских людей, скорее всего, предки носителей этой фамилии были из простого сословия.

Вторая версия смещает акцент на женское имя. Если полное имя Акила — мужское, то женская пара к нему — Акилина (в просторечии Акулина). От Акулины ласкательная форма — та же Акулюша. В таком случае фамилия могла образоваться от имени матери, что бывает реже, но тоже встречается. Например, если женщина была главой семьи или её имя закрепилось за детьми как прозвище.

Третья версия — топонимическая. В Белоруссии, в Мозырском районе, есть село Акульша. Вполне возможно, что человек, переселившийся оттуда, получил прозвище по месту выхода — Акулюша, а его потомки стали Акулюшиными. Эта версия менее распространённая, но географическая привязка делает её реальной.

С точки зрения словообразования всё прозрачно: суффикс -ин указывает на принадлежность. Акулюшин — значит «сын Акулюши» или «человек из рода Акулюши». Фамилия недворянская, без суффикса -ский, что подтверждает её народное, крестьянское или мещанское происхождение.