Фамилия Акуненко — типичный пример украинской модели фамилии на -енко, которая в буквальном смысле означает «сын» или «потомок». В основе лежит имя или прозвище Акуня. Откуда оно взялось — вопрос, на который есть два основных ответа, и оба заслуживают внимания.

Первая и наиболее прямая версия: Акуня — это народная, сокращённая форма редкого крестильного имени Акундин. Имя это греческое, и его значение — «безопасный». Если принять эту версию, то предок носителя фамилии был человеком, которого в быту звали не полным церковным именем, а его обиходным вариантом. Такие формы были распространены в простой среде, так что родоначальник Акуненко, скорее всего, принадлежал к крестьянскому или казачьему сословию.

Вторая версия предлагает смотреть на фамилию шире, с учётом фонетики. В «акающих» говорах (особенно южнорусских и некоторых украинских) безударное «о» нередко произносится как «а». Так фамилия Окуненко могла превратиться в Акуненко. А вот Окуненко, в свою очередь, образована от нецерковного имени Окунь. В древности, ещё до крещения Руси, называть детей по названиям рыб, зверей или птиц было обычным делом. Считалось, что имя-оберег, взятое от природы, защитит ребёнка и передаст ему свойства этого существа — например, ловкость, плодовитость или умение ускользать от опасности.

Какую из версий выбрать? Обе лингвистически обоснованы. Однако версия с рыбой Окунь выглядит даже более правдоподобной: прозвища по названиям рыб (Карась, Щука, Ерш) на Украине и юге России очень часты, и фамилии от них — одна из самых многочисленных групп. Имя же Акундин в народе было редким, и его производная Акуня встречается нечасто. Поэтому вполне вероятно, что перед нами случай, когда редкое крестильное имя и распространённое рыбное прозвище сошлись в одном звучании. В любом случае, Акуненко — это фамилия, которая чётко указывает на украинское происхождение рода и на то, что предка звали по имени или прозвищу Акуня.