Фамилия Акунян — одна из тех, что с первого взгляда не поддаётся однозначной расшифровке, потому что её основа неочевидна. Она образована по армянской модели с суффиксом -ян, который указывает на принадлежность к роду или происхождение из определённой местности. Если бы фамилия звучала как Акунц или Акунянц, это был бы тот же корень, но с другим диалектным окончанием. Исходное слово здесь — «акун» (арм. ակունք), что переводится как «источник», «родник», «ключ». В армянской ономастике это типичный случай, когда фамилию давали по месту жительства: предок носителя жил у родника, колодца или на земле, где били ключи. Такие фамилии особенно распространены в горных районах Армении, где вода — ценный ресурс, и название поселения часто переходило в фамилию.

Реже, но возможно, что в основе лежит личное имя Акун — краткая форма от более длинных имён, например, от Акоп (армянский вариант Иакова) с усечением. В армянской традиции уменьшительные имена с суффиксами -ун, -ан встречаются, но документальных подтверждений такой версии для Акунян мало. Основная гипотеза — топонимическая, и она подкрепляется тем, что в Армении есть сёла и урочища с корнем «акун» (например, Акунк в Гехаркуникской области). Носители фамилии могли происходить оттуда, а при переезде в другие регионы их стали называть по прежнему месту жительства.

С точки зрения словообразования, фамилия Акунян — классический пример армянского патронимического или топонимического суффикса. Если сравнивать с русскими фамилиями, то по смыслу она близка к фамилиям Родников, Ключев, Ключарёв — все они указывают на источник воды. Однако в армянской среде суффикс -ян сохраняет родовую память, а не просто географическую привязку. Социальный контекст: Акунян — фамилия, которая не указывает на знатное происхождение, а скорее на крестьянский или ремесленный род, живший близ воды. В диаспоре (в России, США, Ливане) фамилия встречается, но не входит в число самых частых армянских фамилий вроде Петросян или Оганесян, что тоже говорит о её локальном, а не общенародном распространении.