Фамилия Алафердова принадлежит к распространённому типу русских фамилий, образованных от полных или уменьшительных форм крестильных имён. В её основе лежит имя Алаферд — разговорный, народный вариант канонического церковного имени Елеферий. Само имя Елеферий пришло из греческого языка и означает «свободный». В живой русской речи оно быстро видоизменилось: утратило начальное «е» и перестроилось в более привычные для слуха формы, такие как Алеферий, а затем и Алаферд.

Модель образования фамилии проста: к основе Алаферд добавили патронимический суффикс -ов, а затем женское окончание -а. В буквальном смысле Алафердова — это «дочь (или жена) Алаферда». Такая схема типична для большинства русских фамилий, особенно тех, что возникли в крестьянской и мещанской среде: сначала человека называли по отцу (Иван Алафердов сын), а потом это прозвание закрепилось за всем родом.

Имя Елеферий, от которого всё пошло, в православных святцах связано с двумя святыми: священномучеником Елевферием (иерей) и мучеником Елевферием (диакон). Однако в народе имя редко сохраняло книжную форму — его постоянно «обкатывали», сокращали, приспосабливали к бытовому произношению. Так на свет появился Алаферд, а вместе с ним и фамилия Алафердовы.

Судя по суффиксу и отсутствию дворянских примет (вроде -ский или -инов), родоначальник Алафердовых был, скорее всего, выходцем из рабочей или крестьянской среды. Фамилия встречается нечасто, и это говорит о том, что она сохранила локальный, почти семейный характер — её носители, вероятно, долго жили на одной территории, не смешиваясь с большими потоками переселенцев.