Фамилия Альдикеева — женская форма фамилии Альдикеев. Её основа не славянская, а тюркская, но оформлена по русской патронимической традиции: суффикс «-ев» (в женском роде «-ева») прикрепляли к основам, оканчивающимся на согласный. Такая модель типична для фамилий, которые давали при учёте в ревизских сказках татарам и башкирам: брали имя отца и добавляли русский суффикс.

Корень «Альдик-» восходит к арабскому имени Али с тюркским уменьшительным суффиксом «-дик/-дек». В тюркских языках этот суффикс придаёт имени ласкательный оттенок: «Альдик» могло означать «маленький Али» или «Али-сынок». Имя Али широко распространено у народов, исповедующих ислам, особенно у татар, башкир, казахов. Соответственно, Альдикеев — это «сын Альдика», то есть потомок человека, которого в быту звали Альдик.

Менее вероятная версия — связь с тюркским словом «алдык» (взятое, добытое). В этом случае прозвище Альдик могли дать человеку, занятому сбором дани или добычей. Но антропонимы от абстрактных глагольных форм встречаются реже, чем от личных имён, поэтому первая гипотеза правдоподобнее.

Географически фамилия привязана к регионам компактного проживания татар и башкир — Татарстану, Башкортостану, Оренбургской и Челябинской областям. Встречаемость невысокая, что говорит о локальном происхождении: родоначальник, скорее всего, жил в конкретном ауле или деревне, и фамилия закрепилась за его потомками без широкого расселения.

Носители фамилии в XIX веке, вероятно, относились к государственным или ясачным крестьянам, а не к дворянам или купцам. Дворянских родов с такой фамилией в гербовниках не зафиксировано.