Фамилия Алекаева — редкий пример того, как тюркская словообразовательная модель адаптировала арабское имя. В основе лежит мужское имя Алекай (встречается также вариант Аликай), которое построено по типичной для тюркских языков схеме: к корню добавляется ласкательно-уменьшительный аффикс -кай. Корень здесь — арабское имя Али (означает «возвышенный», «великий»). Получается, что Алекай — это «маленький Али», то есть ласковое, домашнее именование ребенка, названного в честь халифа Али ибн Абу Талиба, почитаемого в исламе.

Суффикс -ев в фамилии указывает на принадлежность: Алекаев — потомок Алекая. Такая модель образования фамилий (имя + -ев) характерна для русской среды, куда фамилия перешла из тюркских языков через процесс обрусения. Фамилия встречается преимущественно в Поволжье и на Урале, в регионах, где веками жили татары и башкиры, а также в среде крещёных татар, что объясняет её русское окончание при тюркской основе.

Стоит учесть, что имя Али могло попасть и в другие местные языки (например, в казахский или чувашский), где аффикс -кай также используется для образования ласкательных форм. Поэтому носители фамилии Алекаева могут иметь разное этническое происхождение, но их объединяет общая модель: домашнее прозвище, закрепившееся за родом. Точное время возникновения фамилии установить сложно — для этого нужны генеалогические изыскания по конкретной ветви, но ясно, что она сложилась не раньше XVI–XVII веков, когда у нерусского населения начали массово фиксировать фамилии по отчеству.