Фамилия Алекаев — один из тех случаев, когда на первый взгляд прозрачная основа ставит перед исследователем больше вопросов, чем ответов. Главная интрига — что лежит в корне: тюркское мужское имя, арабское слово или редкая форма славянского имени.

Самая вероятная версия отводит фамилию к тюркскому имени Алекай. Оно могло быть вариантом имени Али (возвышенный, великий) с добавлением уменьшительно-ласкательного аффикса -кай, что характерно для татарской, башкирской и казахской антропонимии. Алекай в таком случае — «маленький Али» или «Али-батюшка». Суффикс -ев указывает на русскую модель образования: Алекаев буквально значит «сын Алекая» или «из рода Алекая». Фамилия распространена среди татар, башкир и в среде крещёных тюркских народов Поволжья.

Менее распространённая, но лингвистически возможная версия — связь с арабским корнем «алака» (связь, привязанность). В этом случае прозвище Алекай могли дать человеку верному, преданному, «привязанному» к семье или общине. Однако эта гипотеза слабее: для тюркской среды типичнее образование прозвищ от личных имён, а не от абстрактных понятий.

Третья версия, почти экзотическая, — искажение славянского имени Алексей через народную форму Алексай. В диалектах северных губерний России действительно встречается форма «Алека» как сокращение от Алексей. Тогда Алекаев — это «Алексеев» в местном произношении. Но против этого говорит география: подавляющее большинство носителей фамилии Алекаев сосредоточено в Татарстане, Башкортостане и Оренбуржье, что указывает на тюркские корни.

Особенность фамилии — её относительная редкость. В отличие от массовых Алексеевых или Алиевых, Алекаевых немного, и это делает фамилию хорошим маркером для генеалогического поиска: если вы встретили однофамильца, с большой вероятностью у вас общие корни в пределах одного-двух селений на юго-востоке европейской России.