Фамилия Алекпаев — редкий пример, где тюркский корень соединился с русским патронимическим суффиксом. Основа здесь — личное имя Алекпай, которое в свою очередь восходит к арабскому Али (высокий, возвышенный) и тюркскому компоненту «бай» (господин, богач, хозяин). Таким образом, Алекпай — это «богатый Али» или «господин Али». Подобные составные имена были широко распространены у татар, башкир и других тюркских народов Поволжья и Приуралья.

Суффикс -ев указывает на типичную для русской ономастики модель «чей?» — сын Алекпая. Фамилия оформлялась уже в русской среде, когда носителю или его потомкам нужно было вписаться в систему государственного учёта, где требовалась фамилия по отцу. Это говорит о том, что предок Алекпаевых, скорее всего, был крещёным татарином, мишаром или башкиром, перешедшим в православие, или же жил в зоне активного русско-тюркского пограничья — в Казанской, Оренбургской или Уфимской губерниях.

Географически фамилия встречается крайне локально, что характерно для поздних и нетиражированных образований. Основные очаги — Татарстан, Башкортостан, Оренбуржье. Встречаются единичные носители в Казахстане, что связано с переселениями начала XX века. В дореволюционных списках фамилия почти не фиксируется, что подтверждает её позднее оформление — скорее всего, во второй половине XIX века, когда крестьяне и мещане массово получали фамилии.

Интересная деталь: в фамилии сохранился начальный «а» (Алекпаев), хотя в тюркских языках имя часто произносится как «Әлипбай» или «Алипбай». Это говорит о том, что русский писарь записал имя на слух, не вникая в тонкости местного произношения. Встречаются и варианты написания — Алипбаев, Алепбаев, но Алекпаев — наиболее русифицированная форма, где «к» возникло, вероятно, из-за оглушения звонкого «г» в позиции перед глухим согласным.

Сословно предки Алекпаевых, скорее всего, относились к государственным или ясачным крестьянам, реже — к тептярям (сословие, сочетавшее черты крестьян и казаков). Дворянских корней у фамилии нет. В советское время фамилия не получила широкого распространения, оставаясь в пределах нескольких семейных кланов, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска: если вы Алекпаев, ваши корни почти наверняка ведут в одно из сёл на юго-востоке Татарстана или северо-западе Башкортостана.