Фамилия Алекснина образована от имени Алексня — народной, разговорной формы крестильного имени Алексей. В древнегреческом языке имя Алексей означало «оберегающий», «защитник». Но в русской традиции такие уменьшительные формы, как Алексня, бытовали не в церковной, а в бытовой, повседневной среде. Именно это указывает на социальный контекст: скорее всего, основатель рода был человеком из простого сословия — крестьянином или ремесленником, где полное церковное имя использовали редко, заменяя его более привычными в обиходе вариантами.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — Алекснин). Это типичный патроним, который закрепился в фамилию у потомков человека по имени Алексня. В ономастике такие фамилии называют «полуотчествами» — они возникли раньше, чем полные отчества на -ович, и были распространены в среде непривилегированных сословий.

Интересно, что фамилия Алекснина встречается реже, чем её «старший брат» Алексин, образованный от более распространённой формы Алекса. Алексня — форма более редкая, а значит, и фамилия несёт отпечаток локального или семейного словоупотребления. В некоторых говорах, особенно в северных и центральных русских областях, суффикс -ня мог придавать имени оттенок ласкательности или, наоборот, просторечности. Таким образом, фамилия Алекснина — не просто наследник имени, но и свидетельство того, как в конкретной семье называли предка: не торжественно, а по-домашнему.