Фамилия Алепкин — один из тех случаев, когда за привычным русским окончанием скрывается имя греческого происхождения. В основе лежит народная форма Алепка от крестильного имени Алипий (в просторечии — Алипат). С греческого оно переводится как «беспечальный», что звучит почти иронично, если вспомнить житие святого.

Святой покровитель имени — преподобный Алипий Киево-Печерский (конец XI — начало XII века). Он вошел в историю как первый известный русский иконописец, а его биография полна деталей, которые объясняют, почему имя не затерялось в веках. С иконами Алипия связывали чудеса: один образ Богородицы трижды оставался невредимым — сначала при пожаре на киевском Подоле, потом когда рухнула церковь в Ростове Великом (куда икону отослал Владимир Мономах) и снова во время пожара в том же Ростове. Сам Алипий был известен нестяжанием: все заработанные за иконы деньги делил на три части — на материалы, бедным и в монастырь. А однажды исцелил прокаженного, помазав его лицо красками, «ими же иконы писаше».

Словообразовательная модель проста: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — сын Алепки). Это типичная патронимическая фамилия, образованная от уменьшительной формы имени, а не от полного церковного варианта. Такие фамилии в русской среде чаще всего возникали в XVI–XVII веках в среде крестьян и посадских людей, где полное имя употребляли редко, а в быту пользовались краткими формами.

Изредка можно встретить версию, что Алепкин связан не с Алипием, а с топонимом Алеппо (сирийский город). Но эта гипотеза слабая: фамилия фиксируется в центральных русских областях, где связи с Ближним Востоком были единичными, а массовое бытование формы Алепка как варианта имени Алипий подтверждается историческими документами.

Фамилия встречается в основном в центральной России и Поволжье, но массовой статистики по ней нет — это редкая фамилия. В дореволюционных источниках носители Алепкины записаны в основном как крестьяне и мещане, что типично для фамилий, образованных от уменьшительных форм крестильных имен без «дворянского» суффикса -ский.