Фамилия Аликеев происходит от личного имени Аликей. Чаще всего его считают диалектной формой тюркского имени Аликул, которое означает «раб Али» — то есть человека, посвящённого четвёртому праведному халифу Али, почитаемому в исламе. Такая модель образования имён («Али» + «кул/гул» — раб) широко распространена среди тюркских народов. Однако есть и другая версия: имя Аликей могло сложиться из двух компонентов — Али и тюркского слова «кёй» (деревня, село). Тогда значение имени — «деревня Али», что указывает на происхождение по месту жительства или на родовое поселение.

Суффикс -ев в фамилии Аликеев указывает на принадлежность: «сын Аликея» или «из рода Аликеевых». Такая модель типична для русских фамилий тюркского происхождения, которые оформлялись по русскому патронимическому образцу. Географически фамилия встречается среди татар, башкир и других народов Поволжья и Приуралья, где были распространены имена с корнем «Али». Интересно, что в некоторых диалектах могла произойти замена конечного звука: Аликей вместо более привычного Аликул, что говорит о региональных особенностях произношения.

Таким образом, предки носителей фамилии Аликеев, скорее всего, были людьми, получившими имя Аликей при рождении — либо как «раб Али», либо как выходец из села, названного в честь Али. Это имя могло принадлежать и знатному роду, и простому крестьянину, но в любом случае оно крепко связано с тюркской и исламской культурной традицией.