Фамилия Алипханов — одна из тех, где на стыке имён и титулов рождается сложный, но прозрачный смысл. Она образована по стандартной русской модели: к основе «Алипхан» прибавили суффикс -ов, который указывает на принадлежность («чей?»). Так в XIX веке в крестьянской и мещанской среде фиксировали фамилии по отцу: Алипханов — сын Алипхана.

Сама основа — составное арабско-тюркское имя Алипхан. Первая часть, «Алип», скорее всего, восходит к арабскому «алиф» (первый, начальный) или является диалектной формой имени Али (высокий, возвышенный). В тюркских языках, особенно в кумыкском, ногайском и карачаево-балкарском, «алип» также может означать «великан», «богатырь». Вторая часть — «хан» — тюркский титул верховного правителя, который в именах часто служил пожеланием власти и достоинства. Таким образом, Алипхан — это либо «первый среди ханов», либо «хан-богатырь».

Географически фамилия Алипханов уходит корнями на Северный Кавказ, прежде всего в Дагестан и Чечню. Встречается она и у ногайцев, и у народов, испытавших сильное влияние тюркской ономастики. В дореволюционных записях фамилия могла писаться и как Алипханов, и как Алыпханов — через «ы», что отражает реальное произношение в некоторых диалектах.

Сословно носители фамилии относились к разным слоям: от горских узденей (свободных общинников) до зажиточных крестьян. В метрических книгах конца XIX — начала XX века Алипхановы встречаются среди жителей Терской и Дагестанской областей. Фамилия не получила широкого распространения за пределами Кавказа, поэтому её носители обычно могут проследить свою родословную до конкретного аула или села.

Отдельного внимания заслуживает суффикс. В отличие от фамилий на -ин, которые чаще образуются от основ на -а/-я, Алипханов использует -ов, что для тюркских и кавказских имён на согласный — самый частый способ русификации. Если бы фамилия оформлялась по местной традиции, она звучала бы как Алипхановъ (в дореформенной орфографии) или просто Алипхан.