Фамилия Алишерова — яркий пример того, как русская словообразовательная модель наложилась на имя восточного происхождения. Она образована от мужского имени Алишер, которое имеет тюркско-персидские корни и переводится как «лев Али» (от арабского «Али» — возвышенный, и персидского «шер» — лев). В мусульманском мире это имя носил, например, великий поэт и мыслитель Алишер Навои, что придаёт фамилии определённый культурный вес.

Ключевая особенность — суффикс «-ов-», который в русской традиции указывал на принадлежность: «чей сын?» — «Алишеров». Изначально это было отчество: сын Алишера. В отличие от фамилий на «-ин», которые чаще образовывались от основ на -а, -я, здесь сработала модель для мужских имён, оканчивающихся на согласный (ср. Иванов, Петров). Окончание «-а» указывает на женскую форму фамилии, то есть исходная мужская фамилия — Алишеров.

Фамилия эта довольно редкая и, скорее всего, имеет позднее происхождение — не ранее второй половины XIX — начала XX века, когда у народов Средней Азии и Кавказа начали массово фиксировать фамилии по русскому образцу. Носители фамилии, вероятно, происходят из регионов, где распространён тюркский или иранский языковой ареал: Узбекистан, Таджикистан, Азербайджан, а также татарские или башкирские семьи в России.

Встречается любопытный вариант написания с буквой «е» — Алишерова, что может быть связано с особенностями передачи звука «е» в документах или с диалектным произношением. В любом случае, основа одна — личное имя, которое в прошлом было прозвищем или именем отца, а затем закрепилось как фамильный знак.