Фамилия Алькаева образована от мужского имени Алькай. Это не самостоятельное имя, а диалектная, народная форма арабского имени Галий (Гали). В тюркской и кавказской языковой среде звук «г» в начале слова часто переходил в «а» или опускался, так и появился вариант «Алькай» вместо «Галий». Имя Галий в переводе с арабского означает «великий, наивысший, могущественный, превосходящий всех» — это один из эпитетов Аллаха, поэтому имя было широко распространено среди мусульманских народов.

Фамилия построена по стандартной русской модели: к основе «Алькай» добавили притяжательный суффикс «-ев», который указывает на принадлежность: «Алькаев» буквально значит «сын Алькая». Женская форма «Алькаева» закрепилась в документах по правилам русской грамматики.

Интересно, что фамилия встречается в двух основных ареалах: у татар (особенно в Закамье и Приуралье) и у осетин. У осетин, принявших ислам, имя Алькай также бытовало, но фамилия могла закрепиться с другим ударением. В татарской среде фамилия Алькаев (и её женский вариант) фиксируется с XIX века, когда у татар начался массовый процесс закрепления фамилий после ревизий и переписей.

Процесс формирования фамилий вообще был долгим: в разных регионах и сословиях он шёл с разной скоростью. Поэтому говорить о точном месте и времени возникновения конкретного рода Алькаевых можно только на основе генеалогических изысканий — метрических книг, ревизских сказок или современных ДНК-тестов. Сейчас фамилия встречается нечасто, но сохраняет прямую связь с древним именем, которое несли предки.