Фамилия Алькапов — редкий случай, когда основа, скорее всего, не славянская, а тюркская, хотя оформлена она типично русским патронимическим суффиксом -ов. Если отбросить окончание, остаётся корень «Алькап». В нём угадывается тюркское имя Алкап (или Алкап-бай), которое могло состоять из двух частей: «ал» (красный, алый, а также «брать» или «герой») и «кап» (мешок, сосуд, или же форма имени Капитолий, но это менее вероятно). Однако более правдоподобная версия связывает фамилию с арабским именем Аль-Каб (или Аль-Кааб), что значит «пятка» или «каблук» — такое прозвище могли дать человеку с характерной походкой или особенностью стопы.

В русской ономастике фамилия Алькапов стоит особняком: у неё почти нет «родственников» среди распространённых русских фамилий. Она не встречается в списках боярских и дворянских родов, не фиксируется в классических словарях вроде Унбегауна. Это говорит о том, что её носители — скорее всего, потомки крещёных татар, башкир или представителей других тюркских народов, которые получили фамилию по имени или прозвищу предка при переходе в православие. Географически фамилия тяготеет к Поволжью и Уралу, где исторически происходила активная ассимиляция тюркского населения.

Есть и более прозаичная, бытовая версия: Алькапов могло образоваться от прозвища Алькап, данного человеку, который торговал или носил алые шапки (от тюркского «ал кап» — «красный мешок» или «алый головной убор»). В таком случае перед нами не имя, а ремесленное или внешнее прозвище, которое со временем закрепилось за родом. Учитывая, что суффикс -ов в фамилии указывает на принадлежность («чей?» — Алькапов сын), исходное слово точно было личным именем или прозвищем, а не названием профессии в чистом виде.

Таким образом, Алькаповы — это, вероятно, потомки человека по прозвищу или имени Алькап, жившего среди тюркоязычных народов, но влившегося в русскую культуру. Фамилия осталась локальной, не получила широкого распространения, и её носители до сих пор могут быть сконцентрированы в нескольких регионах — от Татарстана до Оренбуржья.