Фамилия Алькова ведет свое начало от имени Альк, варианта мусульманского мужского имени Гали, которое в переводе с арабского означает «великий, возвышенный, высший, наивысший; высокопоставленный; дорогой; мощный, сильный, могущественный». Также это имя в значении «превосходящий над всеми» является одним из 99 эпитетов Аллаха. Имя Гали имеет и другие диалектные варианты, от которых образовались родственные фамилии: Алиев (Али), Галикаев (Галикай), Алькаев (Алькай), Алышев (Алыш) и др. Согласно другой, менее правдоподобной гипотезе, фамилия Алькова связана с названием ниши в стене — Алькова, служащей спальней или местом для бесед. Слово «Алькова» было заимствовано из арабского языка (alqubba‎‎ — «шатёр, маленькая комната») и первоначально обозначало любое спальное помещение или даже отделённую занавесью кровать. Теперь оно употребляется преимущественно только относительно таких небольших боковых комнат, куда свет проникает не непосредственно извне, а только из других комнат через стеклянные двери или окна. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Альковых можно лишь на основании генеалогических исследований.