Фамилия Алтышева — женская форма, мужская — Алтышев. Её основа восходит к тюркскому слову «алтыш» (шесть, шестой). В русских говорах и документах XVI–XVII веков этим словом нередко называли шестого ребёнка в семье или человека, получившего что-то шестое по счёту — надел, долю. Иначе говоря, Алтыш — это не имя, а прозвище, данное по порядку рождения.

Суффикс -ев указывает на принадлежность: Алтышев буквально значит «сын (или потомок) Алтыша». Такая модель образования типична для русской ономастики, особенно в среде, где тюркские прозвища переходили в наследственные фамилии без перевода. Обратите внимание: суффикс именно -ев, а не -ов. Это говорит о том, что основа оканчивалась на мягкий согласный или шипящий — Алтыш.

Географически фамилия привязана к Поволжью и Уралу — зоне давних контактов русского и тюркского населения. В переписях XVII века в Казанском уезде упоминаются крестьяне с прозвищем Алтыш; они могли быть как обрусевшими татарами, так и русскими, перенявшими бытовое тюркское имя. Сословно носители фамилии относились к крестьянам и посадским людям — дворянских родов Алтышевых не зафиксировано.

Есть и другая версия происхождения. В ряде тюркских языков «алтыш» имеет также значение «шестипалый» (от «алты» — шесть и «ыш» — палец). Не исключено, что прозвище могли дать человеку с шестью пальцами на руке. Однако версия с порядковым номером ребёнка считается более вероятной: она проще и чаще встречается в документах.

В современной России фамилия Алтышева остаётся редкой, её носители в основном сосредоточены в Чувашии, Татарстане и соседних областях.