Фамилия Андрюнины образована от имени собственного, а точнее — от производной формы крестильного имени Андрей. В основе лежит имя Андрюня, которое в русской народной традиции было одной из обиходных, «домашних» форм канонического имени. Само имя Андрей пришло из древнегреческого языка, где означало «мужественный», так что корень фамилии несёт этот смысл, хотя и через уменьшительно-ласкательное прозвище.

Словообразовательная модель фамилии проста и прозрачна: суффикс -ин указывает на принадлежность. В русском языке фамилии на -ин (как и на -ов/-ев) типичны для северных и центральных областей России. Андрюнины — буквально «чьи?» — дети, потомки Андрюни. Такой способ образования фамилий был особенно распространён в XV–XVII веках, когда прозвище или имя отца закреплялось за всей семьёй.

Интересно, что форма Андрюня встречается реже, чем более привычные Андрюша или Андрейка. Это делает фамилию Андрюнин редкой по сравнению с массовыми Андреевыми или Андрюшиными. Вероятно, в основу легло местное, диалектное произношение имени — в некоторых говорах суффикс -юн- использовался для образования имён с ласкательным или, наоборот, фамильярным оттенком (ср. Петюня, Ванюня).

О точном месте и времени возникновения фамилии сейчас говорить сложно — процесс формирования русских фамилий растянулся на несколько столетий, и документальные свидетельства по редким фамилиям часто утеряны. Можно предположить, что первые носители фамилии жили на территории, где были сильны северные или вятские говоры, так как именно там суффикс -юн- встречается в личных именах чаще.

Фамилия Андрюнин — не просто семейное прозвище, а памятник живой народной речи. В ней сохранилась та форма имени, которая почти не попала в официальные документы, но бытовала в повседневном общении. Потомки Андрюни, сами того не зная, пронесли через века не только имя предка, но и интонацию, с которой его произносили.