Фамилия Анищеков — редкий случай, когда написание и звучание разошлись, и это не ошибка, а отражение живой речи прошлого. На слух её легко принять за вариант фамилии Овсянников или Аничков, но на деле перед нами совсем другая словообразовательная модель.

Основа фамилии — прозвище или неканоническое имя Анищек. Это уменьшительная форма от Аниска, которое, в свою очередь, восходит к крестильному имени Анисий (от греческого anysis — «исполнение, завершение»). Суффикс -ек- в имени Анищек указывает на ласкательно-уменьшительное значение: «маленький Аниска» или «сын Аниски». Форма с щ (а не с ск) — результат древнего чередования в славянских языках: ск переходило в щ перед гласными переднего ряда (в данном случае перед е). Это не орфографическая прихоть, а закономерный фонетический процесс, который закрепился в письменных документах.

Фамилия образована по стандартной патронимической модели на -ов: Анищеков буквально означает «сын Анищека». В отличие от фамилии Аничков (от Аникей, Аника), где корень другой, и от Овсянников (от овсянка, каша), здесь основа сугубо личная, а не профессиональная. Судя по географическому распространению, фамилия встречается преимущественно в центральных и северных областях России — там, где имя Анисий было популярно в крестьянской среде, а уменьшительные формы с суффиксом -ек- особенно характерны для северных говоров. Именно в этих говорах чередование ск/щ было особенно последовательным, что и объясняет закрепление формы Анищеков.

Интересно, что написание через щ закрепилось в документах, хотя в живой речи фамилию могли произносить и как «Анискеков». Это типичный случай, когда письменная фиксация «заморозила» диалектное произношение XVII–XVIII веков. Предки носителей фамилии, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, а не дворянами: фамилии на -ов от прозвищ с суффиксом -ек редко встречаются в родословных книгах высших сословий. Такие модели типичны для непривилегированных слоёв, где имя Анисий было распространено в обиходных, бытовых формах.