Фамилия Анистрахов — одна из тех русских фамилий, чья основа почти стёрта временем, но восстанавливается через церковную традицию. В её основе лежит каноническое имя Анистрат — народная форма греческого имени Анастасий (Ἀναστάσιος), что значит «воскресший». В русском просторечии имя Анастасий нередко звучало как Анистрат, Анастрат, а через суффикс принадлежности -ов образовалась фамилия Анистрахов, то есть «сын Анистрата».

Словообразовательная модель здесь простая и типичная для крестьянской и мещанской среды XVII–XIX веков: суффикс -ов указывает на отчество или прозвище отца. Однако если присмотреться, фамилия стоит особняком: имя Анистрат встречается реже, чем Анастасий, поэтому и Анистраховых значительно меньше, чем, скажем, Анастасьевых или Настасьиных. Возможно, это результат диалектного произношения в южнорусских или украинских говорах, где «а» в безударной позиции закрепилось, а «с» перед «т» оглушилось — так Анастасий превратился в Анистрата.

Есть и менее вероятная версия, что основа восходит к греческому слову «стратос» (войско) с приставкой «ани-», но она не выдерживает критики: ономастика уверенно связывает фамилию с христианским именем. В пользу церковного происхождения говорит и то, что имя Анастасий было популярно среди духовенства — носители фамилии Анистрахов могли происходить из семей причетников или священников, где такие имена давали по святцам.

Географически фамилия тяготеет к центральным и южным регионам России: Курская, Воронежская, Тамбовская губернии. Там в подворных переписях XIX века нередко встречаются крестьяне и однодворцы с фамилией Анистрахов. В современной России она остаётся довольно редкой — по данным открытых телефонных справочников, основные очаги сосредоточены в Белгородской и Липецкой областях.

Таким образом, Анистрахов — не дворянская и не купеческая фамилия, а типичная фамилия человека, чей предок носил имя, данное при крещении, но в его местном, бытовом варианте.