Основой фамилии Анисов послужило церковное имя Онисим. Мужское крестильное имя Онисим в переводе с греческого означает «полезный». В основу фамилии легла производная форма имени — Анис. Согласно другой гипотезе, фамилия Анисов образована от производной формы мужского крестильного имени Анисий («исполнение, завершение») - Анис. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Анис, со временем получил фамилию Анисов.