Фамилия Антохин начинается с разговорной формы имени Антон — Антоха. Такая модель образования (основа на -х- плюс суффикс -ин) типична для русских фамилий, возникших в крестьянской и мещанской среде: от уличных, домашних прозвищ, которые давали человеку в быту. Антоха — это не официальное имя, а уменьшительно-ласкательное или, в некоторых говорах, просторечное обращение к Антону. Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: «чей?» — Антохин, то есть сын или потомок Антохи.

Само имя Антон восходит к греческому Антоний (Ἀντώνιος) — древнеримскому родовому имени, которое в народной этимологии сближали с греческим глаголом «антао» — «вступать в бой, состязаться». Отсюда традиционный перевод: «противоборец, вступающий в бой». Однако в русской повседневности имя Антон не несло героического оттенка — оно было одним из распространённых крестьянских имён, и фамилия Антохин фиксируется в документах прежде всего в центральных и южнорусских губерниях.

Фамилия Антохин — не единственная в этом гнезде. От той же основы Антон через разные суффиксы образовались Антонов, Антошин, Антоненко, Антонцев. Но Антохин стоит особняком: суффикс -ох-/-ех- в русских фамилиях встречается реже, чем -ов или -ин, и часто указывает на прозвищное, а не патронимическое происхождение. То есть Антохой могли называть не просто сына Антона, а человека с каким-то характерным признаком — например, говорливого, шумного или, наоборот, угрюмого, в зависимости от местного говора.

В ономастических словарях фамилия Антохин не относится к числу дворянских — она бытовала в среде государственных крестьян и однодворцев. Встречается в записях XVI–XVII веков, но массово закрепилась после отмены крепостного права, когда крестьянам массово присваивали фамилии по имени отца или деда. Таким образом, Антохин — это не «княжеская» фамилия, а живая память о предке, которого в деревне звали Антоха.