Фамилия Анускин — редкий пример, когда основа угадывается не сразу, а суффикс подсказывает ключ к разгадке. Принадлежит к типично русской модели на -ин, указывающей на принадлежность: «чей?» — Анускин, то есть сын или потомок человека по имени или прозвищу Ануска.

Что скрывается за этим Ануской? Самая прямая версия — это производная форма от крестильного имени Ануфрий (церковная форма — Онуфрий). В русской народной среде длинные имена постоянно усекали: Онуфрий превращался в Онушку, Анку, а затем и в Ануску. Суффиксы -ск- в фамилии нет, поэтому Анускин — не от географического названия, а от личного имени. Таким образом, предок носителя фамилии мог быть Ануфрием, которого в быту звали Ануской.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным словом «анус», которое в некоторых говорах означало «утка» (сравните с «анутка»). Тогда прозвище Ануска мог получить человек с утиной походкой или любящий разводить эту птицу. Однако ономастика чаще склоняется к антропонимическому, а не нарицательному происхождению, тем более что имя Ануфрий было широко распространено.

Фамилия встречается довольно редко, с заметной концентрацией в центральных областях России — в Рязанской, Тамбовской, Нижегородской губерниях, где имя Онуфрий было особенно популярно. В отличие от фамилий на -ов (Ануфриев), вариант Анускин говорит о более тесной, бытовой форме общения: так могли назвать не по полному имени, а по домашнему, ласкательному прозвищу. По сословному составу носители фамилии в XIX веке — преимущественно крестьяне и мещане, то есть люди, в среде которых имена активно переделывались на свой лад.