Фамилия Анушкин — редкий пример того, как уменьшительное имя перешло в фамилию почти без изменений. В её основе лежит каноническое имя Анна, но не напрямую, а через народную форму Анушка. В русской традиции имя Анна давало целый веер производных: Анка, Аня, Нюра, Нюся, и Анушка — одна из ласкательных версий, бытовавшая в южнорусских и украинских говорах. Суффикс -к- в имени указывал на уменьшительность, а фамильный суффикс -ин стандартно обозначал принадлежность: «чей?» — Анушкин, то есть сын или потомок Анушки.

Интересно, что фамилия могла возникнуть и по другой модели — от прозвища Анушка, которое давали не только женщинам. В некоторых регионах так звали мужчину, отличавшегося мягким, кротким нравом или, наоборот, изнеженностью. Ономасты отмечают, что фамилии на -ушкин часто образовывались от женских имён, если семья была материнской по статусу — например, у вдов или одиноких матерей. В случае с Анушкиным это особенно вероятно, так как Анна — одно из самых распространённых женских имён в православной среде.

С точки зрения словообразования, фамилия стоит в одном ряду с Ванюшкиным, Манюшкиным, Танюшкиным — все они от ласкательных форм на -ушк-. Но Анушкин выделяется тем, что основа не усечена: полное имя Анна дало форму Анушка, тогда как, скажем, от Марии получилось бы Марушкин. Географически фамилия встречается преимущественно в центральных и южных областях России, особенно в Воронежской и Ростовской, что подтверждает её связь с южнорусским диалектом, где звук «у» в уменьшительных суффиксах был нормой.

Дворянских родов Анушкиных не зафиксировано — фамилия почти наверняка крестьянская или мещанская. В дореволюционных переписях её носители чаще всего записаны как однодворцы или государственные крестьяне. Споров о происхождении почти нет: версия с тюркским корнем (например, от «ануш» — сладкий) маловероятна, так как суффикс -ушк- чисто славянский, а фамилия не имеет параллелей в татарских ономастиконах. Так что Анушкин — это фамилия-память о женщине, чьё ласковое имя закрепилось за целым родом.