Фамилия Апекина — женская форма, а её мужской вариант Апекин. В центре внимания здесь не географическая привязка и не сословная история, а редкая и неочевидная основа. Слово «апека» в русских говорах не зафиксировано как самостоятельное, но в диалектах встречается глагол «апеть» — то есть кричать, плакать, издавать громкие звуки. Отсюда могло образоваться прозвище Апека — крикливый, шумный человек, возможно, капризный ребёнок или задира. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Апекин — сын Апеки.

Версия с иноязычным корнем тоже имеет право на существование. В тюркских языках «апек» или «апеке» может означать «старший», «почтенный», «уважаемый». Если предок носителя фамилии был выходцем из татарской или башкирской среды, прозвище Апека могло закрепиться как уважительное обращение. Однако для русского ареала более вероятна первая, диалектная версия — просто потому, что фамилия встречается в основном в центральных и северных регионах России, где «апеть» как раз и бытовало.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: усечённое прозвище на -а плюс притяжательный суффикс. Аналогов много: Крикин, Плаксин, Вопин — все они построены по тому же принципу от глаголов, описывающих голосовое поведение. Но Апекин стоит особняком: если бы основа была от «аппетит» или «аптека», фамилия звучала бы как Аппетитов или Аптекин. Случайное совпадение с этими словами маловероятно.

В документах фамилия фиксируется с XVII века, но массово не распространилась. Апекины — не дворянский род, не купеческая династия. Скорее всего, это фамилия крестьянская или мещанская, возникшая в среде, где прозвища давали по характеру или манере поведения. Сегодня носителей немного, и основная часть живёт в Костромской, Вологодской и Кировской областях — как раз в зоне бытования севернорусских говоров.