Фамилия Аратсков образована по редкой словообразовательной модели, что сразу выделяет её среди более привычных русских фамилий. В её основе лежит суффикс -ск-, который обычно указывает на географическое или топонимическое происхождение: такую фамилию получали выходцы из определённого места, владельцы поместья или переселенцы. Однако полная форма — Аратсков — содержит ещё и суффикс -ов, что типично для фамилий, возникших от прозвищ или имён на -ско. Скорее всего, исходным было прозвище Аратец (человек из местности с корнем «арат»), а уже от него через притяжательное прилагательное образовалась фамилия.

Корень «арат» в русском языке неоднозначен. Самая вероятная версия связывает его с тюркским словом «арат» — «пахарь, земледелец, скотовод». В таком случае прозвище Аратец могло означать «кочевник» или «степняк», но не в уничижительном смысле, а как указание на род занятий или происхождение предка из южных степных регионов, где контакт с тюркскими народами был обычным делом. Менее убедительно выглядит связь с греческим «арете» (доблесть) — это слишком книжно для крестьянской среды, где фамилии чаще возникали стихийно.

Географически фамилия Аратсков встречается редко, что говорит о её локальном происхождении. Основные очаги — юг России и Поволжье, зоны активного взаимодействия с тюркскими народами. В дореволюционных переписях такую фамилию могли носить государственные крестьяне или однодворцы — потомки служилых людей, охранявших южные границы. Сословная принадлежность точно не устанавливается, но суффикс -ск- редко встречается у крепостных крестьян центральных губерний: он более характерен для казачьих или служилых слоёв.

Ономастический словарь Б. Унбегауна относит подобные фамилии (с корнем «арат») к группе, образованной от этнонимов или прозвищ, связанных с тюркским миром. Спорные версии (например, от имени Арат, якобы существовавшего в древнерусских святцах) не подтверждаются источниками — такого имени в православных месяцесловах нет. Таким образом, наиболее правдоподобно, что предок носителя фамилии Аратсков был либо выходцем из степных районов, либо человеком, чьё прозвище закрепилось за его потомками как напоминание о кочевых корнях.