Фамилия Арефина образована от мужского канонического имени Арефий, которое имеет спорное происхождение. По одной из версий, в его основе лежит арабский глагол «пахать» или нарицательное «орел». Согласно другой гипотезе, это имя восходит к греческому слову, имеющему значение «доблестный, добродетельный». В основе данной фамилии лежит производная форма этого имени - Арефа. Скорее всего, основатель рода Арефиных был человеком из простого сословия. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Арефа, со временем получил фамилию Арефина.