Фамилия Аубеков ведёт начало от мусульманского мужского имени Аубек. Как и большинство имен восточного происхождения, имя Игисен имеет сложную основу. Первая часть этого имени восходит к древнетюркскому слову «ау», которое в переводе на русский язык означает «отец; истинный владелец Вторая часть восходит к тюркскому «бек» - «князь, повелитель, начальник, руководитель, глава, хозяин, господин». Вероятно, родители, нарекая ребёнка именем Аубек, желали своему сыну стать мудрым и уважаемым человеком.