Основой фамилии Аверкин послужило имя Аверка. Однако в некоторых местностях Аверьян – это искаженная форма имени Валериан (в переводе с латинского – «здоровый, сильный»). Таким образом, потомок человека, обладающего именем Аверка, со временем получил фамилию Аверкин.