Фамилия Авилкин образована от имени Авилка — это уменьшительная или обиходная форма старинного мужского имени Вавила. Само имя Вавила восходит к арамейскому слову, которое означает «ворота Бога» или «житель Вавилона». Таким образом, предок носителя фамилии Авилкин — человек по имени Авилка, а сама фамилия отвечает на вопрос «чей?»: сын или потомок Авилки.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: суффикс -ин указывает на принадлежность, характерную для русских фамилий, образованных от личных имён, прозвищ или названий профессий, оканчивающихся на -а или -я. В данном случае основа — Авилк-, где -к- является уменьшительным суффиксом, типичным для народных форм крестильных имён (ср. Вавила → Авилка). Такая модель была особенно распространена в северных и центральных губерниях России, где фамилии на -ин встречаются чаще, чем на -ов, из-за особенностей местных говоров.

Имя Вавила в святцах встречается редко, но известно по нескольким раннехристианским святым, в том числе священномученику Вавиле Антиохийскому. В народной среде это имя часто переиначивали, сокращая до Авила или Авилка — так же, как Авдей превращался в Авдюшку, а Вавила в просторечии звучал как Авила. В документах XVI–XVII веков встречаются крестьяне и посадские люди с именем Авилка, например, в переписных книгах Новгородской и Вологодской земель. Это позволяет предположить, что фамилия Авилкин могла возникнуть именно в тех краях.

Интересно, что фамилия Авилкин не имеет отношения к птице «авилка» — такого слова в русском языке нет. Это чисто антропонимическое образование, и все попытки связать её с каким-либо ремеслом или предметом быта ошибочны. Встречается фамилия и в форме Авилков, но она гораздо реже и, вероятно, возникла под влиянием южнорусской традиции, где предпочитали суффикс -ов.

Сегодня фамилия Авилкин редкая, но не исчезающая: её можно встретить в Поволжье, на Урале и в некоторых областях Центральной России. Носители фамилии, как правило, не знают о библейском корне своего родового имени, хотя именно в нём — ключ к пониманию происхождения: за простым крестьянским Авилкой стоит древнее имя, связанное с одним из величайших городов древности.