Фамилия Авилко стоит на двух китах: украинский суффикс -ко и имя Аввакум. Суффикс -ко — типично украинский формант, который в XVI–XVIII веках выполнял роль «сыновьего» показателя: от имени или прозвища отца образовывали фамилию для потомка. В этом Авилко родственна тысячам фамилий на -енко, -ук, -чук, но отличается именно суффиксом -ко, который чаще встречается на западе и в центре Украины.

Основа фамилии — народная форма канонического имени Аввакум. В церковных святцах имя означало «объятие» (от древнееврейского), но в быту его сокращали до Авил, Авила, отбрасывая начальное «Ав» или усекая конец. От такой обиходной формы Авил с суффиксом -ко и возникло Авилко — буквально «сын Авила» или «маленький Авил». В записях XVII–XVIII веков имя Аввакум встречается нередко, но именно его разговорные варианты дали жизнь десяткам фамилий: Авилов, Авилкин, Авелко — и Авилко в их числе.

Географически фамилия привязана к Волыни и Подолью, где суффикс -ко особенно активен. В России она редка и чаще встречается в русифицированной форме Авилков, когда к основе добавили русский суффикс -ов, переделав украинскую модель на привычный лад. Сама форма Авилко сохраняет исходное звучание и указывает на украинское происхождение рода.

Споров о происхождении почти нет: все версии сводятся к имени Аввакум. Альтернативные гипотезы — например, от тюркского корня — слабы и не имеют поддержки в ономастике. Теоретически фамилия могла возникнуть от прозвища, но тогда прозвище должно было звучать как Авил, а оно, скорее всего, было бы связано с тем же именем. Поэтому версия с именем остаётся основной.

Социальный контекст прост: фамилия несёт следы крестьянского и казачьего быта, где отчество отца закреплялось за детьми без сословных изысков. Никаких дворянских корней или редких привилегий за ней не числится — это обычная народная фамилия, каких тысячи на украинских землях.