Фамилия Аврутин образована от просторечной формы библейского имени Авраам — Аврута. Имя Авраам в переводе с древнееврейского означает «отец народов», но в народной, бытовой среде оно приобрело сокращённый, обиходный вариант. Именно от него — Аврута — и пошла фамилия. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Аврутин, то есть потомок человека по имени Аврута.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: основа Аврут- плюс типичный русский притяжательный суффикс -ин. Такая модель характерна для фамилий, возникших в среде, где имя отца или прозвище становилось родовым обозначением семьи. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще образовывались от имён и прозвищ на твёрдый согласный, -ин присоединялся к основам на -а, -я, что и произошло с Аврутой.

Важная деталь: имя Аврута — не каноническая, а именно просторечная, разговорная форма. Она бытовала в еврейской среде на территории Российской империи, особенно в черте оседлости. Фамилии такого типа нередко фиксировали не церковное, а домашнее, обиходное имя предка. Поэтому носитель фамилии Аврутин, скорее всего, происходит из семьи, где имя Авраам в быту звучало как Аврута.

Других версий происхождения у этой фамилии нет: корень однозначно восходит к антропониму, а не к названию ремесла, географическому объекту или прозвищу. Это редкий случай, когда ономастический анализ не оставляет пространства для споров. Географически фамилия встречается в основном у потомков еврейского населения западных губерний, что подтверждается данными переписей и метрических книг XIX — начала XX века.