Фамилия Автушко образована от просторечной формы имени Евстихий — Автуха. Греческое Евстихий означает «счастливый» или «меткий», но в украинских и южнорусских говорах, где аканье было нормой, имя превратилось в Автуху. К этой основе добавили уменьшительно-ласкательный суффикс -ко, типичный для украинской и белорусской ономастики. Получилось Автушко — буквально «маленький Автуха» или «потомок Автухи».

Суффикс -ко в фамилиях Восточной Украины и Беларуси часто указывал на молодого человека или сына: так же образованы Бойко, Шевченко, Тимошко. В случае Автушко модель сработала дважды: сначала полное имя Евстихий сократили до Автухи (как Евстафий дал Остапа, а Евдоким — Авдокима), а затем добавили типичный «сыновний» суффикс.

Интересная деталь: в польских и литовских метриках XVI–XVII веков встречается форма Awtuszko — с буквой «w» вместо «в», что выдает запись латиницей. Это подтверждает, что фамилия бытовала на землях Речи Посполитой, где смешивались православные и католические традиции имянаречения. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые закрепились в великорусских землях, Автушко осталось в зоне влияния украинского и белорусского языков.

В современной России фамилия редкая. По данным открытых баз, большинство носителей сосредоточено в Брянской области и Краснодарском крае — регионах, куда в разное время переселялись выходцы с Украины. В Беларуси Автушко встречается чаще, особенно в Гродненской и Брестской областях.