Фамилия Айдаков имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркского прозвища Айдак. Фамилия Айдаков восходит к прозвищу Айдак, которое образовано от татарского понудительного оклика "айда", "гайда" - "иди скорей", "ступай", "погоняй". Скорее всего, подобное прозвище мог получить один из нойонов татаро-монгольского войска, распряжавшийся пленными. Известно, что в астраханских и казанских говорах существовало выражение "ехать айдаком", то есть "без седла, на голой лошади". В этом случае Айдаком могли прозвать лихого и ловкого наездника.