Фамилия Айдаков — одна из тех, что уходят корнями в тюркскую среду и несут на себе отпечаток кочевой культуры. Её основа — прозвище Айдак, а само слово напрямую связано с татарским понудительным окликом «айда» (или «гайда»), то есть «иди скорей», «ступай», «погоняй». Вряд ли такое прозвище давали просто так: скорее всего, оно закрепилось за человеком, который привык распоряжаться, подгонять других — возможно, за одним из нойонов (предводителей) в татаро-монгольском войске, кому поручали вести пленных или управлять обозом.

Но есть и другая, бытовая версия. В астраханских и казанских говорах бытовало выражение «ехать айдаком» — то есть без седла, на голой лошади. Лихой и ловкий наездник, который мог скакать без снаряжения, тоже мог получить прозвище Айдак. Так что перед нами не один, а два возможных портрета предка: либо властный распорядитель, либо удалой всадник.

Словообразовательная модель фамилии проста и типична для восточно-славянского ареала: суффикс -ов присоединился к основе Айдак, обозначив принадлежность — «сын Айдака» или «из рода Айдака». Такая модель массово закреплялась у русских в XVI–XVII веках, когда оформлялись фамилии у служилых людей и крестьян, в том числе из татарских и башкирских родов, переходивших на русскую службу.

Фамилия Айдаков встречается в Поволжье, особенно в Татарстане и Башкортостане, а также в Оренбургской области — то есть в регионах, где веками соседствовали тюркские и славянские языки и обычаи. Она не относится к числу очень распространённых, но и редкой её не назовёшь: носители встречаются стабильно, что говорит о давнем укоренении рода.