Фамилия Айдулина — женская форма, а мужская, Айдулин, образована по самой распространённой в русском языке модели: от основы, оканчивающейся на согласный, плюс суффикс -ин. Это указывает на то, что предок носителя фамилии был известен под прозвищем или именем Айдула. Суффикс -ин, в отличие от -ов/-ев, чаще использовался в северных и восточных регионах России, что хорошо согласуется с географией фамилии.

Самая вероятная версия — тюркское происхождение. Имена, начинающиеся с «Ай-», широко распространены у татар, башкир, казахов. «Ай» означает «луна» или «месяц». Вторая часть, «дула», может восходить к тюркскому «тул» — «вдова», «овдовевший». Таким образом, Айдула — составное имя-прозвище, которое можно истолковать как «лунная вдова» или «овдовевшая при луне». Звучит поэтично, но на деле прозвище, скорее всего, закрепилось за женщиной, потерявшей мужа в полнолуние, или за ребёнком, родившимся в такую ночь. Менее вероятная версия — связь с арабским именем Айдулла («раб Луны»), но в исламской традиции имена с компонентом «Алла» (Бог) встречаются часто, а «Ай» в таком контексте — явление редкое, скорее доисламское или народное.

Географически фамилия Айдулина чаще всего встречается в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях — регионах с исторически сильным тюркским населением. Встречаются единичные случаи и у русских, что объясняется ассимиляцией и смешанными браками. Сословно предки Айдулиных могли быть как крестьянами, так и служилыми людьми — например, казаками или толмачами, поскольку тюркские имена в XVI–XVII веках не были редкостью среди поволжских служилых татар. Однако точных сведений о принадлежности к конкретному сословию без генеалогического исследования нет.