Фамилия Айдуллин — один из ярких примеров тюркского пласта в русском ономастиконе. Она образована по классической русской модели: к основе «Айдул» добавили суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?»). Такой способ словообразования характерен для фамилий, возникших в среде крещёных татар, башкир и других тюркских народов, которые в XVI–XIX веках переходили в православие и получали фамилии по отцу.

В основе лежит сложное тюркское имя Айдулла (вариант — Айдул). Оно состоит из двух корней: «ай» (луна, месяц) и «дулла» — искажённая форма арабского «Абдулла» (раб Аллаха). В тюркской антропонимике «ай» часто выступает как компонент имён со значением «красивый, светлый, священный». Таким образом, имя Айдулла можно перевести как «светлый раб Аллаха» или «лунный раб Божий». Это теофорное имя, то есть содержащее указание на бога, — распространённый тип у мусульманских народов.

Встречается фамилия в основном в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской, Челябинской и Самарской областях — регионах традиционного расселения татар и башкир. Встречаются варианты написания: Айдулов (с более русифицированным суффиксом -ов) и Айдуллин (с характерным татарским удвоением «л»). Удвоение — не случайность, а отражение тюркского произношения: в исходном имени «Айдулла» согласный «л» долгий, и при переносе в русскую графику это часто передаётся двойной буквой.

Сословное происхождение носителей фамилии неоднородно. Среди Айдуллиных были и государственные крестьяне, и служилые татары (тептяри, башкиры-вотчинники), и представители мусульманского духовенства. В метрических книгах XIX века эта фамилия встречается как у крещёных татар (кряшенов), так и у мусульман — в записях на татарском языке арабской графикой. Фамилия не редкая, но и не массовая: её носители — потомки конкретных родов, а не разросшегося клана.

Интересная деталь: имя Айдулла встречается в эпосе и фольклоре тюркских народов как имя богатыря или мудреца. Это могло повлиять на популярность имени, но не на саму фамилию — она, как и положено, возникла из отчества. Так что предок первого Айдуллина, скорее всего, был человеком по имени Айдулла, уважаемым в своей общине.