Фамилия Бабаджанова — один из примеров того, как восточное личное имя становится родовым прозвищем. В её основе лежит мусульманское мужское имя Бабаджан, которое образовано от двух корней. Первый корень — «баба» — восходит к персидскому языку и означает «отец, батюшка» (в тюркских языках это слово также приобрело значение «дед, старец»). Второй — «джан» — в переводе с персидского значит «душа». Дословно имя Бабаджан можно перевести как «душа отца», однако в переносном смысле его трактуют как «старец с широкой душой» или «уважаемый человек». Имя было популярно в мусульманской среде, особенно в Средней Азии, где составные имена с компонентом «джан» (например, Ахмаджан, Турсунджан) традиционно давали с пожеланием душевной теплоты.

Фамилия образована по стандартной для русского языка модели: к основе имени прибавили суффикс -ов (-а) и окончание, указывающее на принадлежность. Таким образом, Бабаджанова — это буквально «дочь (или жена) человека по имени Бабаджан». В мужском варианте фамилия звучит как Бабаджанов. Такая схема типична для фамилий, возникших у народов, вошедших в состав Российской империи, когда местные имена адаптировали под русскую грамматику.

Представители рода Бабаджановых встречаются в исторических документах. В фонде «Шахидлар Хотирасы» (Узбекистан) упоминаются Астан Бабаджанов, родившийся в 1881 году и проживавший в Бухарской области; Бабакалон Бабаджанов (1875 года рождения) — там же; а также Джаббарберген Бабаджанов (1905 года рождения) из Каракалпакской АССР. Эти записи показывают, что к началу XX века фамилия уже прочно закрепилась в Средней Азии, в основном на территории современных Узбекистана и Каракалпакстана.

Среди носителей фамилии есть люди, оставившие след в науке. Например, советский и таджикский астроном Пулат Бабаджанович Бабаджанов — его имя и отчество повторяют корень фамилии, что нередко встречается в культурах, где имя отца становится основой для фамилии сына.

Говорить о точном месте и времени возникновения рода можно только на основании генеалогических исследований, но сама структура фамилии и её корни указывают на восточное происхождение, связанное с персидской и тюркской языковой средой. Фамилия Бабаджанова — не просто родовое имя, а отражение традиции давать детям составные имена с глубокими пожеланиями мудрости и душевного богатства.