Фамилия Бабаджанов имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Бабаджанов уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Бабаджанов являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Бабаджанов образована от мусульманского мужского имени Бабаджан. Оно, в свою очередь, образовалось от двух арабских имен: Баба и Джан. Первое из них переводится на русский язык как "отец, батюшка", а второе — "душа". Таким образом, дословный перевод имени Бабаджан звучит как "душа отца". Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Бабаджанов способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Бабаджанов представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.