Фамилия Бабарин образована от прозвища Бабара, которое восходит к топониму Бабарино — это название деревни, расположенной в Суздальском районе Владимирской области. Вероятно, родоначальник Бабариных был уроженцем этого населенного пункта. Согласно другой версии, фамилия Бабарин имеет тюркское происхождение и восходит к нарицательному «баба», что в переводе на русский язык означает «отец, дед», а «-р-» - это древний показатель множественного числа. Менее вероятно, что данная фамилия связана с нарицательным «бабарыка» - «головастая рыбка». Тогда в ее основе лежит мирское имя Бабара. Давая младенцу такое имя, как Бабара, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделён избранный представитель животного или растительного мира. Однако не исключено, что в основе этой фамилии лежит не мирское имя, а прозвище, которое могли дать человеку с большой головой, либо рыболова.