Фамилия Бабенков образована от прозвища Баба. Вероятно, так прозвали человека, которого воспитала бабушка или же просто некая крестьянка (то есть в просторечии баба). Кроме того, словом «баба» на юге называли «каменный, грубый истукан возле древних курганов». Скорее всего, фамилия Бабенков первоначально возникла на территории Украины или Белоруссии, о чем свидетельствует характерный суффикс -енко-. Затем, возможно, род Бабенко переехал в Россию, где и произошла русификация фамилии с помощью суффикса -ов.