Фамилия Бабуро — редкий случай, когда географический акцент в происхождении перевешивает все остальные версии. С высокой вероятностью это украинская или белорусская фамилия, образованная не от славянского корня «баба» (как могло бы показаться на первый взгляд), а от тюркского или восточного имени Бабур. В пользу этой версии говорит окончание на -о, типичное для украинских фамилий, которые не прошли русификацию через суффиксы -ов или -ин.

Если отталкиваться от восточного корня, то основа — Бабур, что в переводе с древнетюркского означает «тигр», «лев» или «герой». Наиболее известный носитель этого имени — основатель империи Великих Моголов Захир-ад-дин Мухаммад Бабур. В русскую ономастику такие имена попадали через контакты с татарами, башкирами или народами Кавказа, а затем, при переходе в украинскую или белорусскую среду, обрастали местным окончанием. Таким образом, предок человека с фамилией Бабуро мог получить прозвище за силу, храбрость или просто носить тюркское имя Бабур, которое затем закрепилось как фамилия.

Менее вероятная, но возможная версия — происхождение от уменьшительной формы имени Баба (от Вавила или от слова «бабушка»). В таком случае Бабуро — это что-то вроде «малыш, детка», но такое прозвище редко становилось фамилией без дополнительного суффикса. Окончание -о в этом случае указывало бы на украинскую огласовку: в русском языке от той же основы получилась бы фамилия Бабурин или Бабуров.

Из-за редкости фамилии сложно назвать определённый регион, где она бытовала массово. Скорее всего, это единичный случай перехода восточного имени в украинскую фамилию, и её носители сосредоточены в центральной или восточной Украине, а также в приграничных районах России. В словарях русских фамилий (например, у Унбегауна) эта фамилия не фигурирует, что подтверждает её локальный и нерусский характер.